В 1990 году, в преддверии столетия со дня рождения М. А. Булгакова, по инициативе ряда творческих союзов, деятелей культуры и искусства был учреждён Фонд им. М. А. Булгакова в статусе общественной организации. Председателем Фонда была избрана Мариэтта Омаровна Чудакова. В 1994 году мемориальная квартира писателя, находившаяся в аварийном состоянии, была официально передана Фонду им. М. А. Булгакова под руководством М. О. Чудаковой.
Важнейшей своей целью Фонд считал сохранение мемориальной квартиры Булгакова для российского общества с обязательным свободным доступом в определённые часы всех желающих. А в них тогда (как и теперь) недостатка не было. Было приложено немало усилий — и это удалось. В стенах квартиры небольшой коллектив энтузиастов, состоявший в основном из творческой молодёжи, под руководством исполнительного директора Фонда И. О. Мишиной вёл большую культурную, исследовательскую и просветительскую деятельность — всё на общественных началах.
Здесь проходили театрализованные представления, научные конференции, литературные вечера, художественные и фотовыставки, музыкальные концерты. Доступ в квартиру был свободным. И в мае 2007 года в мемориальной квартире М. А. Булгакова (объединившей квартиры 50 и 41) по Большой Садовой, дом 10, по инициативе Департамента культуры города Москвы был учреждён первый в России Государственный музей М. А. Булгакова. Основу экспозиции составили ценные мемориальные предметы семейного архива, переданные племянницами писателя: доктором филологических наук Е. А. Земской (1926–2012) и кандидатом химических наук В. М. Светлаевой (1929–2014) — на временное хранение В. Ф. Дименко для дальнейшей передачи в будущий музей писателя, а также коллекция Благотворительного фонда им. М. А. Булгакова, зарегистрированного В. Ф. Дименко в конце 2007 года. В марте 2008 года Закупочной комиссией, состоящей из сотрудников музея и Департамента культуры Москвы, был подписан Акт о передаче музею гр-кой Дименко всех вышеназванных предметов, которые и должны были стать музейным фондом.
В 2009 году фонды музея значительно пополнились мемориальными экспонатами — предметами мебели и вещами из последней квартиры писателя в Нащокинском переулке, дом № 3/5, поступившими в музей от семьи Л. К. Тарасевича, который был близким другом вдовы писателя Елены Сергеевны и одноклассником её младшего сына.
Попечительский совет
Чудакова Мариэтта Омаровна, член Европейской академии, профессор Литературного института им. Горького — председатель Попечительского совета
Смелянский Анатолий Миронович, доктор филологических наук, булгаковед, Президент Школы-студии МХАТ
Горяева Татьяна Михайловна, доктор исторических наук, директор РГАЛИ
Колганова Ада Ароновна, директор Российской государственной библиотеки искусств
Бунимович Евгений Абрамович, поэт, педагог, публицист, общественный деятель, Уполномоченный по правам ребёнка в г. Москве
Немцев Владимир Иванович, доктор филологических наук, булгаковед, профессор Педагогического университета (г. Самара)
Сванидзе Николай Карлович, историк, тележурналист
Раков Алексей Александрович, кандидат исторических наук, доцент кафедры экономической методологии и истории НИУ ВШЭ, заместитель директора ИАИ РГГУ, доцент кафедры истории России новейшего времени ИАИ РГГУ
Асс Евгений Викторович, российский архитектор и художник, профессор МАРХИ
Волина Галина Адольфовна, вице-президент МБОФ «Фарватер», заместитель председателя Попечительского совета Музея М. А. Булгакова по организационным вопросам.
На 5-м заседании Попечительского совета Государственного музея М. А. Булгакова 14 января 2014 года в числе обсуждаемых вопросов был определены изменения в составе ПС.
Из состава Попечительского совета были выведены два его члена — Елена Андреевна Земская и Варвара Михайловна Светлаева, племянницы Булгакова, в связи с их кончиной.
В состав Попечительского совета были введены три новых члена: Алексей Александрович Раков, Сергей Григорьевич Боровиков и Евгений Викторович Асс.
Из состава членов Попечительского Совета был исключён М. Б. Шапошников.
